В то же время "Соборное уложение" 1649 г. окончательно закрепостило крестьян. Активная внешняя политика, требовавшая больших расходов, и другие мероприятия царской власти вызывают широкое недовольство народа. XVII в. называют "бунтарным веком". Массовые восстания приобретают систематический характер. Можно отметить Соляной бунт (1648 г.), Медный бунт (1662 г.) Они оказали серьёзное влияние на политику властей. В 60-е годы XVII в. активность и массовость народных выступлений нарастает. Стремление царя поставить под свой контроль донское казачество резко обостряет положение в этом регионе. В 1666 г. атаман Василий Ус совершает неудачный поход на Москву. После похода на Каспий в 1667-1668 гг., в мае 1680 г. казацкое войско С. Разина начинает поход на поволжские российские территории. Восставшие поддерживали крестьян и городские низы. Восстание охватило всё Поволжье. Ценой огромных потерь царскому войску удалось в начале 1671 г. подавить основные очаги движения. Разин был казнён. 8 лет продолжалось Соловецкое восстание (1668-1676 гг.) носившее социально-религиозный характер. События "бунтарного века" отражают противоречивое социально-экономическое развитие страны того времени.
Политическое развитие России в XVII веке определялось поиском путей укрепления сильной царской власти, способной удержать единство государства и обеспечить ему стабильное развитие. Попытка И. Грозного в XVII в. решить эту проблему силовым путём до конца не удалась. Боярская дума - оплот оппозиционных царю сил - не только продолжала существовать, но и усилила свою роль в конце века благодаря смене династий. Новые, ещё слабые династии Годуновых и Романовых не могли использовать методы Иоанна IV. Их деятельность была направлена на изменение структуры и функций Боярской Думы. В конце XVI - начале XVII вв. этот орган значительно расширился за счёт привлечения думных дворян - оплота царя из служилых неродовитых фамилий. Кроме того, значительно сократились полномочия Думы, к концу XVII в. она постепенно превратилась в совещательный орган.
Помимо этого цари расширяют свою социально-политическую опору повышением роли Земских соборов, оформившихся в XVI. В первой половине XVII в. эти органы играли очень важную роль в политической жизни. В их состав входили Боярская Дума, высшее духовенство, советные люди (выборные представители от дворян, купцов, городов, посадов и слобод). Усиление роли соборов было вызвано борьбой династий и Смутным временем. Они собирали для принятия ответственных политических решений. Соборы должны были показать общенародную поддержку новой власти и её деятельности. И Б. Годунов, и В. Шуйский, и М. Романов избирались Земскими Соборами. Земский Собор в первые 140 лет царствования М. Романова действовал постоянно и сыграл большую роль в преодолении последствий смуты. Во II половине XVII в. в связи со стабилизацией власти значение соборов упало.
Огромную роль в структуре политической власти России играла церковь. Эта тенденция особенно возросла в I половине XVII в. Патриарху Филарету, отцу М. Романова, был присвоен титул великого государя. Все грамоты писались от лица обоих государей. По мере укрепления царской власти обострялся конфликт между светской и церковной властями. Вершины он достиг в 60-е гг. XVII в. в противостоянии патриарха Никона и царя Александра Михайловича. Победила светская власть. В 1660 г. Никона лишили патриаршества.
XVII в. был временем расцвета приказной системы. Приказы - органы исполнительной власти - были сформированы по отраслевому и территориальному признаку. Их число доходило до 80-90. Они были постоянными и временными. Периодически система подвергалась реорганизации с целью сокращения. Усиление бюрократизации государственного управления укрепляло царскую власть.
В местном управлении выборные органы, получившие распространение при Иване Грозном, постепенно также вытесняются бюрократическими. Складывается государственная вертикаль управления. Все эти изменения позволяют говорить о движении России по пути к абсолютизму.